همسانه سازی، شناسایی و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و روند تکامل ژنتیکی یک ژن تیوردوکسین h از گیاه انگور بیدانه سفید
Authors
Abstract:
تیوردوکسین‌ها (Trxs) پروتئین‌هایی کوچک و مقاوم در برابر حرارت هستند که در حفظ تعادل شرایط اکسیداسیون- احیاء (Redox) سلولی دخالت داشته و در تمام موجودات زنده از پروکاریوت‌ها تا یوکاریوت‌های عالی وجود دارند. در گیاهان عالی، تیوردوکسین‌ها به شش گروه مختلف، شامل تیوردوکسین‌های کلروپلاستی f،m ،x و y، تیوردوکسین میتوکندریایی o و تیوردوکسین‌های h تقسیم‌بندی می‌شوند. تیوردوکسین‌های h با داشتن یک خانواده چند ژنی کوچک در فرآیندهای متعددی از جمله محافظت سلولی در برابر تنش اکسنده دخالت می‌کنند. cDNA کدکننده ژن تیوردوکسین h (VvTrxh3) از بافت برگ گیاه انگور بیدانه سفید (Vitis vinifera L. Bidaneh Sefid)، با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخه‌برداری معکوس (RT-PCR) جداسازی و همسانه‌سازی شده و خصوصیات بیوشیمیایی، ساختاری و روند تکامل ژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. بررسی توالی نوکلئوتیدی نشان داد که چارچوب باز خواندنی ژن همسانه‌سازی شده VvTrxh3 به طول bp345 بوده و یک پروتئین با 114 اسیدآمینه را کد می‌کند. همچنین بررسی توالی پروتئینی این ژن نشان داد که جایگاه فعال آن به صورت WCGPC بوده و وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه آیزوالکتریک پیش‌بینی شده آن به ترتیب برابر 79/12 کیلودالتون و 06/5 و دارای ساختار سه بعدی مختص پروتئین‌های تیوردوکسین، تحت عنوان Thioredoxin Fold می‌باشد. بررسی‌های فیلوژنتیکی و همردیف‌سازی چندگانه نشان داد که این ژن، تیوردوکسین نوع h و متعلق به زیرکلاس IA از زیرگروه I بوده و شباهت زیادی با تیوردوکسین‌های h گیاهان دیگر دارد.
similar resources
همسانه سازی ژن تیوردوکسین h از گیاه انگور (.vitis vinifera l)
تیوردوکسین ها (trxs) پروتئین های کوچکی هستند که به فراوانی در تمام موجودات زنده از پروکاریوت ها تا یوکاریوت های عالی یافت می شوند. آنها از طریق دو اسید آمینه سیستئین موجود در جایگاه فعالشان در واکنش های تیول- دی سولفید شرکت کرده و قادر به احیاء پیوندهای دی سولفید در پروتئین های هدف می باشند. تیوردوکسین ها براساس ساختارهای اولیه پروتئینی و نحوه قرارگیری در اندامک های سلولی، به گروه ها و زیر گروه...
15 صفحه اولهمسانه سازی و تعیین خصوصیات ژن زیر واحد c آنزیم H+- ATPase واکوئلی در گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis
سابقه و هدف : مدیریت جذب، انتقال، تبادل و کده بندی کردن یون ها و تنظیم دقیق نسبت های یونی در گیاهان به واسطه فعالیت مجموعه ای از ناقل ها، حامل ها و کانال های یونی صورت می پذیرد . پمپ یونی H+-ATPase واکوئلی، نقش مهّمی در ایجاد و حفظ شیب الکتروشیمیایی دارد و انتقال یون ها به داخل واکوئل سلول های گیاهی را تحت تأثیر قرار می دهد . فعالیت این پمپ باعث ایجاد نیروی محرکه پروتونی اولیه برای راه اندازی و ...
full textشناسایی، همسانه سازی و تحلیل ساختار ژن تیوردوکسین vvtrxh10) h )جدا شده از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی
جهت بررسی ساختار ژن تیوردوکسین، rna کل از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخه برداری معکوس(rt-pcr) ، کتابخانه cdna تهیه گردید. سپس ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh10 سنتز، جداسازی و در ناقل پلاسمیدی puc19 همسانه سازی شد. نتایج توالییابی نشان داد که قطعه همسانه سازی شده از ژن تیوردوکسین h حاوی یک چارچوب قرائت آزاد منفرد به طولbp...
full textشناسایی، همسانه سازی و تحلیل ساختار ژن تیوردوکسین vvtrxh۱۰) h )جدا شده از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی
جهت بررسی ساختار ژن تیوردوکسین، rna کل از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخه برداری معکوس(rt-pcr) ، کتابخانه cdna تهیه گردید. سپس ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh10 سنتز، جداسازی و در ناقل پلاسمیدی puc19 همسانه سازی شد. نتایج توالییابی نشان داد که قطعه همسانه سازی شده از ژن تیوردوکسین h حاوی یک چارچوب قرائت آزاد منفرد به طولbp...
full textهمسانه سازی cdna ژن تیوردوکسین vvtrxh) h) از بافت حبه انگور رقم یاقوتی (vitis vinifera l. cv. yaquti)
تیوردوکسین ها پروتئین هایی فراگیر و از لحاظ وزن مولکولی کوچک (معمولا شامل 100 تا 120 آمینو اسید) بوده و دارای پل دی سولفیدی انفعالی با توالی های کاملا حفاظت شده - –cys- gly (ala/pro)- pro- cys می باشند. در این تحقیق، پس از استخراج rna کل ازبافت های برگ و حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی، سنتز cdna ازrna استخراجی صورت پذیرفت. ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh ، با استفاده از تکنیک واکنش ز...
15 صفحه اولMy Resources
Journal title
volume 43 issue 2
pages 161- 174
publication date 2012-09-22
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023